Kommentar (Pitt Reitmaier)

Die Pandemie bringt Gesundheitsdienste nicht nur an die Grenzen ihrer kurativen Kapazität, sondern auch an Grenzen der diagnostischen Kapazität und an Grenzen ihrer Ressourcen.

• Antikörperbestimmungen (Serumtests und Schnelltests) lassen schließen, ob die getestete Person in der Vergangenheit Antikörper gebildet hat, also infiziert war. Das Testergebnis sagt nichts aus über das Vorhandensein des Virus, weshalb Antikörperbestimmungen nicht als individualdiagnostischen Tests angesehen werden.
• Molekulartests (PCR) weisen das Virus nach aus Abstrich oder Körperflüssigkeit der getesteten Person. Sie lassen schließen, ob die Person das Virus ausscheidet und somit andere Personen infizieren kann.

Entsprechend Preis und Verfügbarkeit werden wenig geeignete Tests eingesetzt und auch von Behörden vorgeschrieben.
Dieser logische Bruch betrifft viele betroffene Länder. Da ich die Frage der Tests in der Phase der Öffung eines Landes für absolut vorrangig erachte, habe ich begonnen, Argumente für die Debatte zu sammeln:

• in der zeitlichen Abfolge ihres Erscheinens
• ohne den Anspruch auf Vollständigkeit und ohne deren Argumentation zu meiner eigenen zu machen. Zwei Wochen ohne Internet hatten wir keinen Zugriff auf die Literatur.

  Health-Care in Europe 01.04.2020

The mini-pool method allows for increasing test capacities to detect the virus with no decrease in sensitivity.

Graphics: Michael Schmidt, German Red Cross Blood Donor Service, Frankfurt Institute

  Journal of Clinical Virology 23.04.2020

Multi-Stage Group Testing Improves Efficiency of Large-Scale COVID-19 Screening. 

Eberhardt JN, Breuckmann NP, Eberhardt CS.
J Clin Virol. 2020 Jul;128:104382. doi: 10.1016/j.jcv.2020.104382. Epub 2020 Apr 23.

Abstract:

Contexto: Os kits de teste SARS-CoV-2 estão em escassez crítica em muitos países.Isto limita os testes populacionais em grande escala e dificulta o esforço de identificação e isolamento de indivíduos infectados.

Objectivo: Desenvolvemos e avaliámos esquemas de Pool Testinge de várias etapas que testam amostras em pool de tamanhos variados em várias etapas. Através desta abordagem, grupos de amostras negativas podem ser eliminados com um único teste, evitando a necessidade de testes individuais e conseguindo poupanças consideráveis de recursos.

Study design: Concebemos e parametrizámos vários esquemas de testes em várias fases e comparámos a sua eficiência com diferentes taxas de prevalência utilizando simulações computorizadas.

Resultados: Descobrimos que esquemas de testes em três fases com um tamanho máximo de 16 amostras podem testar até três e sete vezes mais indivíduos com o mesmo número de kits de teste para taxas de prevalência de cerca de 5% e1%, respectivamente. Propomos uma abordagem adaptativa, em que o esquema de teste ideal é seleccionado com base na taxa de prevalência esperada.

Conclusão: Estes esquemas de teste de grupo poderiam levar a uma grande redução do número de kits de teste necessários e ajudar a melhorar os testes populacionais em grande escala em geral e no contexto da actual pandemia da COVID-19

Comentário (Pitt Reitmaier)

Uma valiosa contribuição à teoria do Pool Testing e ao incremento da eficiência em função da prevalência.

Ein wertvoller Beitrag zur Theorie des Pool Testings und der Effizienzsteigerung in Abhängkeit der Prävalenz. Ein weiterer Artikel zur Bestimmung der optimalen Poolgröße ist angekundig.

  Live Science 28.05.2020

COVID-19: Wuhan tested millions of people for COVID-19 in just days. Could US cities do the same?

'Batch' testing worked in Wuhan, but it won't work everywhere.

por Nicoletta Lanese

Comentário (Pitt Reitmaier)

Ein ausgewogener, instruktiver Beitrag zur Debatte um Vor- und Nachteile des Pool Testings unter USA-Bedingungen. Eingeschränkt auf die technicalities ohne Berücksichtigung der sozialökonomischen und poltischen Bedingungen.

  Jama Network open 23.06.2020

Simulation of Pool Testing to Identify Patients With Coronavirus Disease 2019 Under Conditions of Limited Test Availability. 

Cherif A, Grobe N, Wang X, Kotanko P.

JAMA Netw Open. 2020 Jun 1;3(6):e2013075. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2020.13075.

Comentário (Pitt Reitmaier)

Contribuição para a teoria dos testes de pool, as tabelas e gráficos são mais fáceis de ler no PDF..

Beitrag zur Theorie des Pool Testings, die Tabellen und Graphiken sind im PDF besser zu lesen.

  Food and Drug Administration USA 18.07.2020

COVID-19: Coronavirus (COVID-19) Update: FDA Issues First Emergency Authorization for Sample Pooling in Diagnostic Testing
Actualização do Coronavírus (COVID-19): FDA emite a Primeira Autorização de Emergência para a Pooling de Amostras em Testes de Diagnóstico

Hoje, a U.S. Food and Drug Administration reemitiu uma autorização de utilização de emergência (AUE) à Quest Diagnostics para autorizar o seu teste Quest SARS-CoV-2 rRT-PCR para utilização com amostras combinadas contendo até quatro amostras individuais de esfregaços colhidos sob observação. O teste Quest é o primeiro teste de diagnóstico COVID-19 a ser autorizado para utilização com amostras combinadas.

O pooling de amostras é uma importante ferramenta de saúde pública porque permite que mais pessoas possam ser testadas rapidamente utilizando menos recursos de teste. O pooling de amostras faz isto permitindo que várias pessoas - neste caso quatro indivíduos - sejam testadas de uma só vez. As amostras recolhidas destes quatro indivíduos são então testadas num pool ou "lote", utilizando um teste, em vez de se executar cada amostra individual no seu próprio teste. Se o grupo for positivo, significa que um ou mais indivíduos testados nesse grupo podem ser infectados, pelo que cada uma das amostras desse grupo é novamente testada individualmente. Como as amostras são agrupadas, espera-se que sejam realizados menos testes em geral, o que significa que são utilizados menos materiais de teste e que podem ser realizados mais testes ao mesmo tempo, permitindo aos pacientes receber os seus resultados mais rapidamente na maioria dos casos. Esta estratégia de testes é mais eficiente em áreas com baixa prevalência, o que significa que se espera que a maioria dos resultados sejam negativos.

"Esta AUE para o pooling de amostras é um importante passo em frente na obtenção de mais testes COVID-19 para mais americanos mais rapidamente, preservando simultaneamente os fornecimentos de testes", disse o Comissário da FDA Stephen M. Hahn, M.D. "O pooling de amostras torna-se especialmente importante à medida que as taxas de infecção diminuem e começamos a testar porções maiores da população".

Embora haja a preocupação de que a combinação de amostras possa tornar mais difícil a detecção de positivos, uma vez que o pooling no laboratório dilui qualquer material viral presente nas amostras, os dados de validação da Quest demonstram que o seu teste identificou correctamente todas as amostras agrupadas que continham uma amostra positiva. É importante notar que o teste Quest, inicialmente autorizado em 17 de Março de 2020, continua autorizado a testar amostras individuais recolhidas pelo seu prestador de cuidados de saúde de pessoas com suspeita de infecção por COVID-19. O teste também continua autorizado para uso com amostras individuais de esfregaços nasais que são autocolhidas em casa ou num ambiente de cuidados de saúde utilizando um kit de recolha domiciliária autorizado quando determinado como adequado por um prestador de cuidados de saúde.

A FDA continua a trabalhar com uma série de criadores de testes de diagnóstico para facilitar novas abordagens e obter mais rapidamente testes adicionais para mais americanos.

A FDA, uma agência dentro do Departamento de Saúde e Serviços Humanos dos EUA, protege a saúde pública assegurando a segurança, eficácia e segurança de medicamentos humanos e veterinários, vacinas e outros produtos biológicos para uso humano, e dispositivos médicos. A agência é também responsável pela segurança e protecção do abastecimento alimentar do nosso país, cosméticos, suplementos alimentares, produtos que libertam radiação electrónica, e pela regulamentação dos produtos do tabaco.

  CDC Atlanta USA 01.08.2020

COVID-19: Interim Guidance for Use of Pooling Procedures in SARS-CoV-2 Diagnostic, Screening, and Surveillance Testing
Orientações provisórias para a utilização de procedimentos de pooling em testes de diagnóstico, rastreio e vigilância da SRA-CoV-2