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Lucete Fortes

COVID-19 Epidemie in Cabo Verde

Cabo Verde map Covid-19
Karte: © Reitmaier / Fortes www.bela-vista.net

Themen-Special 02.08.2020

COVID-19: Pool Testing


Wie erhöht man die Testkapazität im Massenscreening ohne die Kosten im gleichen Maß zu erhöhen?

in Blick auf Ideen und Erfahrungen anderer Länder

Kommentar (Pitt Reitmaier)

Die Pandemie bringt Gesundheitsdienste nicht nur an die Grenzen ihrer kurativen Kapazität, sondern auch an Grenzen der diagnostischen Kapazität und an Grenzen ihrer Ressourcen.
  • Antikörperbestimmungen (Serumtests und Schnelltests) lassen schließen, ob die getestete Person in der Vergangenheit Antikörper gebildet hat, also infiziert war. Das Testergebnis sagt nichts aus über das Vorhandensein des Virus, weshalb Antikörperbestimmungen nicht als individualdiagnostischen Tests angesehen werden.
  • Molekulartests (PCR) weisen das Virus nach aus Abstrich oder Körperflüssigkeit der getesteten Person. Sie lassen schließen, ob die Person das Virus ausscheidet und somit andere Personen infizieren kann.
Entsprechend Preis und Verfügbarkeit werden wenig geeignete Tests eingesetzt und auch von Behörden vorgeschrieben.
Dieser logische Bruch betrifft viele betroffene Länder. Da ich die Frage der Tests in der Phase der Öffung eines Landes für absolut vorrangig erachte, habe ich begonnen, Argumente für die Debatte zu sammeln:
  • in der zeitlichen Abfolge ihres Erscheinens
  • ohne den Anspruch auf Vollständigkeit und ohne deren Argumentation zu meiner eigenen zu machen. Zwei Wochen ohne Internet hatten wir keinen Zugriff auf die Literatur.


 CV-Flag MSNBC 11.03.2020 German Laboratory Ramps Up Production Of New COVID-19 Test | Velshi & Ruhle |

NBC News Chief Foreign Correspondent Richard Engel talks with Yasmin Vossoughian about a German lab that has produced a quicker way to test for the coronavirus, but is still waiting for approval from the FDA.

CV-FlagTECNION 18.03.2020 Pooling Method for Accelerated Testing of COVID-19 from Technion

Technion and Rambam Health Care Campus scientists present a novel method for testing over 60 patients simultaneously

 CV-Flag Health-Care in Europe 01.04.2020

Mini-Pool-Testing
The mini-pool method allows for increasing test capacities to detect the virus with no decrease in sensitivity.
Graphics: Michael Schmidt, German Red Cross Blood Donor Service, Frankfurt Institute

COVID-19: Corona 'pool testing' increases worldwide capacities many times over
Corona 'pool testing' aumenta a capacidade mundial muitas vezes mais

Os investigadores do Serviço de Doação de Sangue da Cruz Vermelha Alemã em Frankfurt chefiado pelo Professor Erhard Seifried, e do Instituto de Virologia Médica do Hospital Universitário de Frankfurt na Universidade Goethe chefiado pela Professora Sandra Ciesek conseguiram desenvolver um procedimento que torna possível aumentar imediata e dramaticamente as capacidades de teste a nível mundial para a detecção da SRA-CoV-2.

..... A ilustração à esquerda mostra o novo método de mini-pool. O esfregaço é primeiro colocado num tubo de ensaio de reserva e posteriormente num recipiente pool. Uma vez que este método de pooling não aumenta o volume no recipiente pool, não se observa nenhuma diluição e, portanto, nenhuma diminuição da sensibilidade. Utilizando amostras de ring trial independentes (pré-teste do ring trial planeado), que foram fornecidas por uma organização de ring trial (INSTAND) autorizada pela Associação Médica Alemã, foi possível demonstrar que o novo método de mini-pool pode obter resultados laboratoriais de qualidade igual à dos obtidos com testes individuais. O novo método foi adicionalmente investigado num pequeno estudo de campo com 50 amostras de doentes não seleccionados . .....

Kommentar (Pitt Reitmaier)

Die Methode des Mini-Pool-Testings erlaubt bis zu 4 Proben gemeinsam zu testen ohne Minderung der Sensitivität, weil die gleichen Teströhrchen verwendet werden wie im Einzeltest. Der praktische Vorteil, ohne zusätzliche Schulung des Personals liegt auf der Hand und drückt die Kosten etwa die Hälfte. Bei der unglaublich hohen Sensitivität des PCR Tests wäre meine Hypothese, dass es kein Fehler ist, in Gesundheitsdiensten armer Länder weitaus mehr Proben in einen Pool zu sammeln, solange die zu erwartende Prävalenz gering ist. Die Sensitivität eines Tests nur einer von vielen Faktoren, die in den Erfolg / Misserfolg einer Maßnahme eingehen
  • Relevanz - Kann der Test die gestellten Frage beantworten? Die Frage nach den aktuell Infektiösen wird mit einem Test, der anzeigt ob der Getestete in seiner Vorgeschichte infiziert war, nicht beanwortet, bei Covid-19 so wenig wie bei Masern.

  • Indikation - Testen wir Schwerkranke im Krankenhaus um die Diagnose zu sichern und das Personal zu schützen oder testen wir auch Leichtkranke in den ambulanten Diensten und wie breit testen wir im Umfeld bekannter Fälle? Suchen wir nach Infektiösen entlang der bekannten Fälle oder legen wir ein Netz von Teststationen aus zur freiwilligen Testung der Bürger? Testen wir Stichproben in wieder geöffneten Schulen oder alle Schüler - und wie häufig?

  • Sensitivität - Wieviele der Träger des Merkmals (zB Infektiöse) werden erkannt (Richtig-Positiv) werden angezeigt, wievile nicht (Falsch-Negativ)?

  • Spezifität - Wieviele der positiven Ergebnisse zeigen etwas anderes als das Merkmal an (Falsch-Positiv)?

Einige Promille der Infizierten nicht zu erkennen, ist nicht so schwerwiegend wie logische Brüche und Verzögerungen im Ablauf:

  • Tests niedriger Relevanz einzusetzen oder als Behörde vorzuschreiben, wenn der relevante Test zu teuer scheint und weniger verfügbar ist.

  • das positive Ergebnis eines weniger relevanten Tests als Indikation zum relevanteren Test vorauszusetzen

  • erschwerter Zugang zur freiwilligen Testung aus Eigeninitiative

  • Wartezeiten auf Ergebnisse verzögern den Beginn von Umfeldkontrollen

  • Niedrige Durchdringung der Bevölkerung mit aktuellen, kostengünstigen, relevanten Tests.


CV-Flag Crux INDIA 06.04.2020 Kerala Develops India's First Walk-In Kiosk For Coronavirus Test

Kalamassery Medical College in Kerala?s Ernakulum has developed a walk-in sample kiosk to collect samples from suspected COVID-19 patients. Watch this video to find out how samples will be collected and why this is a huge boost for medical personnel

CV-Flag Moneycontrol.com INDIA 14.04.2020


CV-FlagPrincipal Health Secretary Utar Pradesh INDIA 16.04.2020


CV-Flag Odisha News INDIA 16.04.2020


CV-Flag Hindustan Times INDIA 17.04.2020
Covid-19 | Pool testing: Method, effectiveness, ICMR guidelines explained

With testing for Covid-19 going up in India, pool testing can turn out to be an effective way. In pool testing, throat swabs from two to five people are mixed together and tested in a single unit. All individual samples in a negative pool are regarded as negative while if a pooled sample tests positive, each person in the pool is tested individually to find out who is affected. Pool testing increases the testing capacities of labs and saves time, reduces cost and lowers manpower. However, pool testing is not meant for people at high risk, like close contacts, health workers, or those who come under high risk. Watch the full video for more details.

 CV-Flag Journal of Clinical Virology 23.04.2020

Multi-Stage Group Testing Improves Efficiency of Large-Scale COVID-19 Screening. 

Eberhardt JN, Breuckmann NP, Eberhardt CS.
J Clin Virol. 2020 Jul;128:104382. doi: 10.1016/j.jcv.2020.104382. Epub 2020 Apr 23.

Abstract:

Contexto: Os kits de teste SARS-CoV-2 estão em escassez crítica em muitos países.Isto limita os testes populacionais em grande escala e dificulta o esforço de identificação e isolamento de indivíduos infectados.
Objectivo: Desenvolvemos e avaliámos esquemas de Pool Testinge de várias etapas que testam amostras em pool de tamanhos variados em várias etapas. Através desta abordagem, grupos de amostras negativas podem ser eliminados com um único teste, evitando a necessidade de testes individuais e conseguindo poupanças consideráveis de recursos.
Study design: Concebemos e parametrizámos vários esquemas de testes em várias fases e comparámos a sua eficiência com diferentes taxas de prevalência utilizando simulações computorizadas.
Resultados: Descobrimos que esquemas de testes em três fases com um tamanho máximo de 16 amostras podem testar até três e sete vezes mais indivíduos com o mesmo número de kits de teste para taxas de prevalência de cerca de 5% e1%, respectivamente. Propomos uma abordagem adaptativa, em que o esquema de teste ideal é seleccionado com base na taxa de prevalência esperada.
Conclusão: Estes esquemas de teste de grupo poderiam levar a uma grande redução do número de kits de teste necessários e ajudar a melhorar os testes populacionais em grande escala em geral e no contexto da actual pandemia da COVID-19

Comentário (Pitt Reitmaier)

Uma valiosa contribuição à teoria do Pool Testing e ao incremento da eficiência em função da prevalência.

Ein wertvoller Beitrag zur Theorie des Pool Testings und der Effizienzsteigerung in Abhängkeit der Prävalenz. Ein weiterer Artikel zur Bestimmung der optimalen Poolgröße ist angekundig.


CV-Flag Live Science 28.05.2020 Will "Pooled Testing" Work in America?

China recently launched a campaign to test every one of Wuhan's 11 million residents for the virus. Less than two weeks into the drive, the city has tested about 6.5 million residents, but how could so many people be tested so quickly?

 CV-Flag Live Science 28.05.2020

COVID-19: Wuhan tested millions of people for COVID-19 in just days. Could US cities do the same?

'Batch' testing worked in Wuhan, but it won't work everywhere.

por Nicoletta Lanese

Comentário (Pitt Reitmaier)

Ein ausgewogener, instruktiver Beitrag zur Debatte um Vor- und Nachteile des Pool Testings unter USA-Bedingungen. Eingeschränkt auf die technicalities ohne Berücksichtigung der sozialökonomischen und poltischen Bedingungen.

 


 CV-Flag Jama Network open 23.06.2020

Simulation of Pool Testing to Identify Patients With Coronavirus Disease 2019 Under Conditions of Limited Test Availability. 

Cherif A, Grobe N, Wang X, Kotanko P.

JAMA Netw Open. 2020 Jun 1;3(6):e2013075. doi: 10.1001/jamanetworkopen.2020.13075.

Comentário (Pitt Reitmaier)

Contribuição para a teoria dos testes de pool, as tabelas e gráficos são mais fáceis de ler no PDF..

Beitrag zur Theorie des Pool Testings, die Tabellen und Graphiken sind im PDF besser zu lesen.


 CV-Flag10 Tampa Bay USA 03.07.2020

It's a new way to expand testing for COVID-19. A way that Dr. Anthony Fauci says may be the key in greatly slowing or stopping the disease's spread.


 CV-Flag AACC 15.07.2020 American Association for Clinical Chemistry USA How Would Pooled Testing Work for COVID-19?


 CV-Flag WDIV USA 18.07.2020

FDA approves 'pool testing' to test more people for COVID-19 at a time

 


 CV-Flag Food and Drug Administration USA 18.07.2020

COVID-19: Coronavirus (COVID-19) Update: FDA Issues First Emergency Authorization for Sample Pooling in Diagnostic Testing
Actualização do Coronavírus (COVID-19): FDA emite a Primeira Autorização de Emergência para a Pooling de Amostras em Testes de Diagnóstico

Hoje, a U.S. Food and Drug Administration reemitiu uma autorização de utilização de emergência (AUE) à Quest Diagnostics para autorizar o seu teste Quest SARS-CoV-2 rRT-PCR para utilização com amostras combinadas contendo até quatro amostras individuais de esfregaços colhidos sob observação. O teste Quest é o primeiro teste de diagnóstico COVID-19 a ser autorizado para utilização com amostras combinadas.
O pooling de amostras é uma importante ferramenta de saúde pública porque permite que mais pessoas possam ser testadas rapidamente utilizando menos recursos de teste. O pooling de amostras faz isto permitindo que várias pessoas - neste caso quatro indivíduos - sejam testadas de uma só vez. As amostras recolhidas destes quatro indivíduos são então testadas num pool ou "lote", utilizando um teste, em vez de se executar cada amostra individual no seu próprio teste. Se o grupo for positivo, significa que um ou mais indivíduos testados nesse grupo podem ser infectados, pelo que cada uma das amostras desse grupo é novamente testada individualmente. Como as amostras são agrupadas, espera-se que sejam realizados menos testes em geral, o que significa que são utilizados menos materiais de teste e que podem ser realizados mais testes ao mesmo tempo, permitindo aos pacientes receber os seus resultados mais rapidamente na maioria dos casos. Esta estratégia de testes é mais eficiente em áreas com baixa prevalência, o que significa que se espera que a maioria dos resultados sejam negativos.
"Esta AUE para o pooling de amostras é um importante passo em frente na obtenção de mais testes COVID-19 para mais americanos mais rapidamente, preservando simultaneamente os fornecimentos de testes", disse o Comissário da FDA Stephen M. Hahn, M.D. "O pooling de amostras torna-se especialmente importante à medida que as taxas de infecção diminuem e começamos a testar porções maiores da população".
Embora haja a preocupação de que a combinação de amostras possa tornar mais difícil a detecção de positivos, uma vez que o pooling no laboratório dilui qualquer material viral presente nas amostras, os dados de validação da Quest demonstram que o seu teste identificou correctamente todas as amostras agrupadas que continham uma amostra positiva. É importante notar que o teste Quest, inicialmente autorizado em 17 de Março de 2020, continua autorizado a testar amostras individuais recolhidas pelo seu prestador de cuidados de saúde de pessoas com suspeita de infecção por COVID-19. O teste também continua autorizado para uso com amostras individuais de esfregaços nasais que são autocolhidas em casa ou num ambiente de cuidados de saúde utilizando um kit de recolha domiciliária autorizado quando determinado como adequado por um prestador de cuidados de saúde.
A FDA continua a trabalhar com uma série de criadores de testes de diagnóstico para facilitar novas abordagens e obter mais rapidamente testes adicionais para mais americanos.
A FDA, uma agência dentro do Departamento de Saúde e Serviços Humanos dos EUA, protege a saúde pública assegurando a segurança, eficácia e segurança de medicamentos humanos e veterinários, vacinas e outros produtos biológicos para uso humano, e dispositivos médicos. A agência é também responsável pela segurança e protecção do abastecimento alimentar do nosso país, cosméticos, suplementos alimentares, produtos que libertam radiação electrónica, e pela regulamentação dos produtos do tabaco.

 CV-Flag MSNBC 27.07.2020


 CV-Flag CDC Atlanta USA 01.08.2020

COVID-19: Interim Guidance for Use of Pooling Procedures in SARS-CoV-2 Diagnostic, Screening, and Surveillance Testing
Orientações provisórias para a utilização de procedimentos de pooling em testes de diagnóstico, rastreio e vigilância da SRA-CoV-2


[Inoffizielle Übersetzungen: Dr. Pitt Reitmaier]

Alle Angaben nach bestem Wissen und Gewissen, doch ohne Gewähr.
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updated: 10.08.20
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